От количества точек все-таки зависит количество хранящихся в системе данных. Также нагрузка на сервер зависит от количества одновременно работающих пользователей.
Редакция Express ограничена одним физическим процессором или 4-мя ядрами, в зависимости от того, что меньше. Например, при наличии 2-х процессоров с двумя ядрами, будет использоваться только 2 ядра одного процессора. В случае с 4-х ядерным процессором используется ограничение в 4 ядра одного процессора.
Обратите внимание, что в отличие от других редакций, редакция Express использует только 1 ГБ оперативной памяти, соответственно при наличии большого количества пользователей производительность сервера падает из-за большого количества операций ввода-вывода с диском.
Для системы с 2000 точек учета я рекомендую не заморачиваться с Express редакцией SQL Server. Такие системы подразумевают большую ответственность, поэтому нужно использовать возможности, предоставляемые коммерческими редакциями, включая планы обслуживания, репликацию данных, высокую доступность и т.д…
Действительно, с точки зрения ЛЭРС УЧЕТ разницы между этими редакциями нет. Если разница в цене для вас не существенна, то выбирайте версию 2017, хотя бы потому, что у нее позже заканчивается поддержка.
Что же по существу исходного вопроса, то если вы планируете использовать SQL сервер только под ЛЭРС УЧЕТ, то возможностей редакции Standard будет более чем достаточно и она полностью задествует ваше железо. Обратите внимание, что в модели лицензирования по количеству ядре, лицензии продаются пакетами по 2, так что вы можете лицензировать Standard только на 2 или на 4 ядра. Я бы рекомендовал для начала взять лицензию на 2 ядра, лицензию на оставшиеся 2 ядра при необходимости можно докупить позже.
P.S. Розничные цены на SQL Server Enterprise примерно в 4 раза выше, чем на Standard. На практике это означает, что за одни и те же деньги вы можете получить Enterprise на 2-х ядрах или отказоустойчивый кластер на 4-х ядрах Standard.