В меню редактирование учетной записи, в объеты/точки/помещения, устанавливаешь нужные точки учета для отображения, то в web интерфейсе не отмеченные точки учета все равно отображаются!
Уточните, пожалуйста, какая версия ЛЭРС УЧЕТ у вас установлена?
Версия 3.38.4
Обновитесь до текущей версии 3.38.5 и проверьте возникает ли описанная ситуация в ней. Если ситуация повториться в текущей версии, приложите ключевые скриншоты настроек учетной записи и скриншот Веб-интерфейса, где видно недоступные данному пользователю точки учета.