В целом здесь нет какого то правильного подхода. Все зависит от целей, которых вы пытаетесь достигнут.
Например, если вы хотите видеть в суточных и месячных рассчитанные данные потребления вместо считанных с прибора, то вам должен подойти первый вариант и при этом вам нужно будет отключить опрос суточных и месячных.
Если вы хотите видеть рассчитанные данные потребления только по отсутствующим в приборе суточным и месячным, то в предыдущем варианте нужно настроить опрос суточных и месячных.
Если вы не хотите видеть вообще рассчитанные данные потребления в суточных и месячных, то стоит отключить их расчет.
Подробнее смотрите в соответствующем разделе документации Расчёт потребления.
в моём случае настроено по первому варианту, но при этом настроен опрос и суточных, и месячных. Может это приводит к какому-то конфликту, о котором я не догадываюсь?
У вам не должно быть перекрестного расчета интеграторов и потребления, когда интеграторы по потреблению, а потребление по интеграторам. Так же не стоит одновременно включать расчет по формулам и вкладке расчета и хранения. В остальном не припомню каких либо ограничений.